Cytoscape

Cytoscape

Cytoscape是一个开源软件平台，用于可视化复杂的网络并将其与任何类型的属性数据集成。
Cytoscape是一个开源软件平台，用于可视化复杂的网络并将其与任何类型的属性数据集成。许多插件可用于各种问题领域，包括生物信息学，社交网络分析和语义网。Cytoscape支持分子和系统生物学，基因组学和蛋白质组学中的许多用例：以多种格式加载分子和遗传相互作用数据集项目并集成全局数据集和功能注释在这些数据上建立强大的可视化映射使用Cytoscape插件执行高级分析和建模可视化并分析人类精心设计的途径数据集，例如Reactome或KEGG。
cytoscape

网站:

特征

分类目录

具有任何许可的所有平台的Cytoscape替代品

Polinode

Polinode

Polinode是一种工具，可以轻松执行强大的网络分析。您可以上传自己的网络数据，也可以使用基于关系的集成调查工具为您收集数据，然后再分析和可视化网络。
  • 付费应用
  • Web
KeyLines Graph Visualization Toolkit

KeyLines Graph Visualization Toolkit

KeyLines是一个JavaScript工具箱，用于快速构建高性能图形可视化应用程序。
Pathomx

Pathomx

Pathomx是用于分析和可视化实验数据的基于工作流的工具。
Prefuse

Prefuse

预熔可视化工具包
Neoclipse
NodeXL
Wandora
Touchgraph Navigator
Tabnetviz

Tabnetviz

基于表的网络可视化器，一种命令行工具，用于从节点表和边缘表生成静态网络可视化。
Socilyzer
Linkurious
Gephi