PlasmaDNA

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PlasmaDNA是免费的DNA分析和处理软件。它易于学习和使用，并且包含旨在帮助以下方面的多种功能：成功克隆策略的设计生成新克隆的序列克隆策略的归档
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具有商业许可证的Mac版PlasmaDNA的替代方案

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DNADynamo-适用于Windows，OSX和Linux。
SimVector

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使用SimVector绘制质粒图谱，进行限制性分析和作图。