忍者印记由面向隐身的2D平台组成。该角色需要在一系列环境中潜行，同时不让警卫人员看不见并进行无声击杀。等级分为光明和黑暗的区域。玩家角色在后者中是不可见的。诸如奔跑之类的声音也可能会泄露玩家角色的位置，并通过快速扩大的圆圈在视觉上表示出来。对于平台游戏者而言不寻常，忍者之印采用视线机制，这意味着即使角色的声音在屏幕上的显示方式也与玩家角色相同，但角色看不见的敌人也对玩家不可见。..通过接近未被发现的敌人，玩家角色能够执行一次一击必杀。为此，玩家可以熄灭光源，躲在物体后面，并穿过狭窄的格栅和敌人无法到达的竖井。如果被发现，他们必须逃避敌人，并在一定时间内保持视野，此后，敌人将返回其原始位置，再次有可能被执行一次命中。敌人对自己的环境和彼此有反应；如果发现玩家角色或发现尸体，他们会发出警报，这将警告该地区的所有敌人。如果他们听到声音或瞥见玩家角色，他们就会变得可疑，在他们的头上显示问号并积极寻找玩家角色。剧情：游戏的故事始于武装部队对忍者基地的攻击。一位不知名的主角在接受纹身后就晕倒了，她被一位名叫Ora的女忍者唤醒。忍者收集自己的装备，就能打败士兵，并与其他同伴一起拯救他的主人Azai。Azai告诉他纹身的力量和周围的传说，并解释了墨水是如何从特殊的沙漠花中获得的，而沙漠花赋予了特殊的技能，但是要付出一定的代价。