BioBlender是基于开源3D建模软件构建的软件包。生物学工作在纳米尺度上，人眼看不见物体。借助BioBlender，可以根据科学数据和最高标准的3D操作来显示构成我们细胞的某些字符。全世界的科学家都在原子级研究蛋白质，并将信息存储在公共存储库蛋白质数据库中，其中每个分子都被描述为其原子及其3D坐标的列表。...借助BioBlender，用户可以在3D空间中处理蛋白质，以逼真的方式显示其表面，并在已知构象的基础上精心设计蛋白质运动。可以从用户定义的目录中加载PDB文件，也可以直接从PDB站点下载PDB文件（通过插入PDB代码）。蛋白质以3D形式显示（作为原子或分子表面），用户可以计算并可视化其表面性质，分子亲脂性电位和静电势。对于蛋白质运动，BioBlender使用Blender Game Engine计算两个构象之间的中间体。该程序将中间的PDB文件和渲染的图像作为电影输出。BioBlender是Blender的实现，Blender是一种开放源代码，免费分发，多平台，可互操作且受支持的3D动画，视觉效果和视频游戏程序。通过将3D计算机图形学，游戏引擎和科学程序结合在一起，BioBlender成为了一种完整的工具，可以利用基于纹理和特殊效果的视觉代码来阐述蛋白质的运动并显示其表面特征。这样，可以显示运动中的分子的物理和化学性质。BioBlender是由位于比萨（意大利）CNR的SciVis小组与不同学科（生物学，化学，物理学，计算机科学）的科学家进行合作的结果。
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